Вяткин окончил Свердловский архитектурный институт в 1973 году и с этого момента вся его профессиональная жизнь неразрывно связана с архитектурой. Первые несколько лет, с 1973 по 1979 он проектировал здания различного назначения для Уральского электромеханического комбината. Следующий этап карьеры – бюро экспертизы в Главсредуралстрое, где он проработал до 1993 года.
В конце 1993 года Михаил Вяткин начал работать в департаменте архитектуры и градостроительства, а в 1996 году возглавил это подразделение, и проработал на этом посту до 2014 года. Во многом, именно Вяткин определял меняющийся облик Екатеринбурга. При нем стали строиться новые микрорайоны, начиная от таких небольших как Северный Химмаш, до громады Академического, который сегодня вырос в восьмой административный район города. При нем появлялись первые торгово-развлекательные центры, начиная с «Дирижабля» на Ботанике, «Парк-Хаус», «Екатерининский» и многие другие, первые пятизвездочные гостиницы. При нем началась в свое время и уплотнительная застройка, и начался рост города ввысь. Кроме того, при непосредственном участии главного архитектора разрабатывалась законодательная база земельного регулирования, появился Генеральный план Екатеринбурга, формировались, как сейчас говорят, «дорожные карты» стратегического развития.
Несмотря на то, что уже шесть лет Михаил Вяткин не занимает официальных административных постов, его мнение остается важным в вопросах архитектуры. Он входит в обновленный состав архитектурно-градостроительного совета при администрации Екатеринбурга и на каждом заседании озвучивает наиболее полную и целостную оценку по рассматриваемым вопросам. Очевидно, что к позиции ветерана главархитектуры прислушиваются и чиновники в мэрии, и застройщики, имеющие долгий бэкграунд работы в Екатеринбурге.